Việc HFIC thực hiện chức năng đại diện chủ sở hữu vốn nhà nước tại các doanh nghiệp được chuyển giao từ Ủy ban nhân dân thành phố của HFIC, được triển khai theo Kết luận số 15-KL/TW ngày 18/10/2007 của Bộ Chính trị, Công văn số 2103/TTg-ĐMDN ngày 04/11/2009 của Thủ tướng Chính phủ và Quyết định số 4538/QĐ-UBND ngày 31/8/2012 của Ủy ban nhân dân thành phố.

Đây là một chức năng đặc thù và riêng có của HFIC nhằm hướng tới 03 mục tiêu chính như sau: (i) Tách bạch được chức năng quản lý nhà nước với chức năng đại diện chủ sở hữu vốn, tài sản nhà nước tại doanh nghiệp; (ii) Thực hiện công tác cổ phần hóa (CPH) doanh nghiệp và quản lý phần vốn của doanh nghiệp sau CPH theo quy định (iii) Tập trung vốn đầu tư để phát triển hạ tầng đô thị Thành phố.

1.1. Thực hiện chủ trương tách bạch chức năng quản lý nhà nước và chức năng đại diện chủ sở hữu vốn và tài sản nhà nước tại các doanh nghiệp:

HFIC là đơn vị tiên phong thực hiện chủ trương tách bạch chức năng quản lý nhà nước và chức năng đại diện chủ sở hữu vốn. Thông qua cơ chế quản trị minh bạch, HFIC đảm bảo quyền tự chủ trong hoạt động sản xuất – kinh doanh của doanh nghiệp, đồng thời thực hiện giám sát, đánh giá và công khai thông tin tài chính theo đúng quy định.

1.2. Thực hiện công tác cổ phần hóa (CPH) doanh nghiệp và quản lý phần vốn của doanh nghiệp sau CPH theo quy định: 

HFIC đã nhận chuyển giao 08 doanh nghiệp, trong đó hoàn thành cổ phần hóa 06/06 doanh nghiệp theo đúng tiến độ, đảm bảo tính chặt chẽ và minh bạch; giá trị doanh nghiệp sau khi xác định lại đã tăng 2,5 lần so với vốn điều lệ ban đầu. 

Sau quá trình CPH các DNTV, HFIC giữ vai trò là một cổ đông tương ứng với phần vốn nhà nước đầu tư tại doanh nghiệp và tiếp tục thực hiện quản lý phần vốn này theo quy định. HFIC phối hợp chặt chẽ với cơ quan tham mưu đề xuất cấp có thẩm quyền cử người đại diện vốn nhằm giám sát, quản lý khoản đầu tư tại doanh nghiệp, thực hiện mục tiêu bảo toàn và phát triển nguồn vốn nhà nước. Từ đó giúp các DNTV hoàn thành tốt các chỉ tiêu nhiệm vụ được chủ sở hữu giao và 100% DNTV được đánh giá “an toàn về tài chính”. 

1.3. Góp phần tập trung vốn đầu tư để phát triển hạ tầng đô thị Thành phố:

Một trong những mục tiêu quan trọng của việc chuyển giao các doanh nghiệp về HFIC là nhằm tổng hợp nguồn lực của các doanh nghiệp được chuyển giao và nguồn lực tài chính, cơ chế huy động của HFIC để phục vụ cho việc đầu tư phát triển kết cấu hạ tầng kỹ thuật, hạ tầng xã hội và các ngành kinh tế quan trọng của thành phố. 

Việc chuyển giao các doanh nghiệp nhà nước độc lập đã góp phần nâng cao năng lực tài chính, tăng quy mô vốn chủ sở hữu của HFIC, tạo thuận lợi hơn trong quá trình đàm phán, huy động các nguồn lực trong và ngoài nước để đầu tư phát triển cơ sở hạ tầng thành phố.